С 1977 г. управляющим Московской епархией, ее правящим архиереем (в границах Московской области, за исключением г. Москвы) является митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий, резиденция которого находится в Новодевичьем монастыре г. Москвы.

Епархия разделена на 47 благочиннических округов, включая монастырский. На 1102 приходах совершают свое служение 1400 клириков, из которых 1287 — в священническом сане, 113 — в диаконском. В монастырях несут послушание 240 насельников: 65 — в мужских и 175 — в женских.

В Московской епархии насчитывается 1506 храмов, из которых 595 — полностью восстановлены, 392 — вновь построены, 136 — находятся в стадии строительства. К приходам и монастырям епархии относятся 268 часовен.